ΑΠΕΙΛΗ για τη δημόσια υγεία αποτελούν χιλιάδες τόνοι νοσοκομειακών αποβλήτων, που καταλήγουν είτε μαζί με τα κοινά σκουπίδια στις χωματερές είτε διοχετεύονται στο αστικό αποχετευτικό σύστημα.
Χωρίς την παραμικρή επεξεργασία διακινείται η συντριπτική πλειονότητα των 15.000 τόνων μολυσματικών αποβλήτων, που παράγονται ετησίως από τα δημόσια και ιδιωτικά νοσοκομεία. Την απουσία μέτρων για τη σωστή διαχείριση των νοσοκομειακών απορριμμάτων επισημαίνει σε ειδική έκθεσή του ο Συνήγορος του Πολίτη.
Στελέχη της Αρχής αντίκρυσαν απαράδεκτες συνθήκες στο πλαίσιο έρευνας σε μεγάλα νοσοκομεία και ειδικότερα στο «Α. Συγγρός», το Γενικό Κρατικό Νικαίας, τον «¶γιο Σάββα», το Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο Λάρισας, το Περιφερειακό Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο Ηρακλείου και το Νοσοκομείο Ρεθύμνου.